全国重点文物保护单位有以下11处：

　　中山陵 位于钟山中部小茅山南麓，于1929年春建成，同年6月1日孙中山安葬于此。整座建筑以我国传统风格为主，融合西方建筑精髓，简相浑厚，坚固美观。主要建筑有祭堂、墓室、碑亭、墓道。祭堂正中有孙中山全身坐像，祭室内有孙中山大理石卧像，卧像下面安葬着孙中山遗体。陵墓附近有音乐台、光华亭、流徽榭等建筑。整个陵园面积8万平方米。1996年被国家确定为全国爱国主义教育基地。

　　明孝陵 是明太祖朱元璋的陵墓，位于紫金山独龙阜玩珠峰下，始建于1381年，1383年建成。陵墙周长22．5公里。为保卫孝陵，内设“神宫监”，外设孝陵卫。现存下马坊、大金门、四方城、神功圣德碑、神道存有翁促、神兽等石刻。

　　天王府遗址 位于长江路292号。1835年，洪秀全领导的太平军攻克南京，在此建都立国。天王洪秀全将原两面三刀江总督府改建为天朝宫殿，俗称“天王府”。天王府分内外两面三刀组建筑，内城叫金龙城，外城叫太阳城。1864年，清军攻入天京，天王府被焚，残留遗迹有西花园的水池和石舫等。中华民国成立后，这里成为民国临时政府所在地，临时大总统孙中山亦在此办公和居住，以后曾一度成为国民政府的总统府。

　　南京城墙 兴建于1366年，1386年建成，历时21年之久。城周长33．676公里，城高14至21米；城基宽20米左右，顶宽21至14米，为当时世界上最大的都城墙。共有城门13座，现存4座，而以聚宝门（今中华门）最为雄伟。该门南北长128米，东西宽118米，面积15000平方米；共设瓮城3座，闸门4道；门内还设有藏兵3000人。城门坚固，易守难攻，为古代军事防御设施的一大创举。

　　南朝陵墓石刻 在南京郊区分布着17处南朝帝陵和王族墓葬。这些陵墓之前大多竖有巨大而栩栩如生的神兽石刻。其中有代表性的是：江宁县境内的宋武帝刘裕初宁陵石刻、栖霞区境内的梁安成康王萧秀墓石刻和始兴忠武王萧憺石刻及临川靖惠王萧宏墓石刻等。它们是中古时代石刻的代表作，具有很高的历史艺术价值。

　　栖霞寺舍利塔 位于栖霞寺，始建于隋，重建于南唐。塔身五级八面，全系白石所垒。塔座有上下两层，为仰莲花座和基坛浮雕八相图。塔身第一层，刻有四门和四天王像，门旁石柱刻《金刚经》。飞檐下刻飞天游空像，第二层以上每层各面均雕两石，一一佛，造型逼真，现保存基本完好。

　　南唐二陵 即南唐先主李煜钦陵及中主李？顺陵，位于江宁县祖堂山。二陵相距百余米，为江南地区较大的地下宫殿。钦陵有三主室、十耳室，墓室内彩画、石雕精美，上部绘有日月星辰，下部刻有江河山岳，另有陶俑及玉哀册等陪葬物。顺陵有大小耳室11间，规模不及钦陵。

　　雨花台烈士陵园 1927年到1949年，国民党反动派在雨花台杀害了成千上万的革命志士。为纪念他们，党和人民政府于1950年兴建了该陵园。1979年以后，国家和省、市投资2300万元，陆续建起了烈士群雕、纪念碑和纪念馆等。邓小平同志为纪念碑和纪念馆题词。1996年被国家确定为全国爱国主义教育基地。

　　堂子街壁画 位于堂子街108号，这里曾是太平天国东王杨秀清属官的衙署，大殿两壁及两厅壁板和山墙保存着山水、花鸟、鱼虫等壁画，具有较高的艺术水平和民族特色，是我国近代壁画艺术中的珍品。

　　紫金山天文台 1929年始建，1934年建成，位于南京东郊紫金山上，整个建筑融中国传统风格与西方建筑精髓于一体。主要建设物有60厘米反射望远镜变呈仪室、子午仪室、大台、赤道仪室、太阳分光仪室、变量仪室等。紫金山天文台是一座综合性天文台，是中国近代天文科学的摇篮，目前主要从事天体物理、天体力学、射电天文和实用天文等方而后研究工作。

　　梅园新村纪念馆 原为解放战争时期以周恩来为领导的中共代表团办公场所。1954年筹建纪念馆，1978年正式建立中共代表团梅园新村纪念馆，1990年1月8日建成“国共南京谈判史料陈列馆”，同年7月1日落成周恩来全身铜像。陈列馆是一座具有地方物理学现代化建筑，馆内用汉白玉雕刻着中共领导成员和工作人员的群像。自1990年以来，梅园新村纪念馆共接待国内外观众340多万人次，1996年被国家确定为全国爱国主义教育基地。

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